Репутация где находится?

Теперь репутация - это уважение на самом форуме.
Репутация находится в Администрирование > Настройки > Возможности.

На сегодняшний день вы можете выбрать один из трех вариантов репутаций:

1) только плюсы
2) плюсы и минусы
3) сумма плюсов и минусов

или отключить ее совсем.

Как изменить название темы?

Чтобы изменить название темы, нужно редактировать первое сообщение
этой темы (отмечено красным), потом сохраняете.

Дополнительные пункты меню
Как поставить дополнительную ссылку на сайт?

Свои ссылки можно поставить как дополнительные пункты верхнего меню форума: Администрирование > Настройки > Возможности

Чтобы поменять ссылку, нужно ввести следующее:

<a href="cсылку вставляем тут">Тут название ссылки</a>
Что зелёным цветом - номер очерёдности, его можно сменить, поставив 1 или 2 и так далее.

Цензура.
Цензура используется для замены рекламы или непристойных слов.
Для ёё работы нужно Активировать её в разделе
Администрирование > Настройки > Возможности

Далее выбираем пункт Цензура в Администрировании, слева пишем слово плохое, справа заменяющий текст в пустых строчках

Некоторые пояснения к пункту Настройки:

1. Название форума - тут и говорить нечего

2. Временная зона - это часовой пояс, в котором будет работать ваш форум. Она может и не совпадать с вашим личным часовым поясом, который вы меняете в своем Профиле.

3. Основной стиль и стиль пользователя. Тут вы выставляете стиль своего форума по умолчанию - то есть, каким его будут видеть гости и пользователи, которые только что зарегистрировались. Если вы ответите ДА на вопрос "Разрешить пользователям выбирать свой стиль оформления форума?", то они смогут у себя в Профиле в пункте Отображение установить для себя лично и другую цветовую гамму, другой стиль оформления форума, если НЕТ всё с точностью тогда не смогут.

4. HTML-низ и верх.  Используются для вставки туда кодов и скриптов, например, вниз можно поставить баннеры и счетчики, в верх - шапку форума. Но не только. Подробнее о кодах читайте на всем этом форуме

5. Каталог. Тут вы определяете категорию в каталоге, в которой хотите показать свой форум. Проще говоря, тематику вашего форума.

6. Формат даты и времени. Ну, тут все понятно. Единственное, если не знаете и/или не хотите разбираться в других форматах, не пишите туда что попало и не стирайте то, что есть.

7. Тайм- ауты - это время бездействия пользователя. То есть если он ничего не пишет на форуме, не ходит по ссылкам, через некоторое время он не будет отображаться в списке активных пользователей и т.п.

8. Переадресация - время перехода между страничками при различных действиях пользователя.

9. Блок "Отображение" - там все понятно описано, читайте подсказки.

10. Быстрый ответ  Удобно, когда включено. Тогда, чтобы ответить в теме, пользователю не нужно загружать новую страничку с формой ответа.

11. Пользователи Online. Список активных пользователей на главной странице форума, а также в каждой теме.

12. Цензура, ранги и доп. пункты меню - см. выше в этой  теме написано.

13. Метка и поиск - понятно, читаем подсказки в Админке.

14. Похожие темы. Включает под текущей темой отображение списка из пяти ссылок на темы с похожей тематики  на Вашем Форумe

15. Репутация -  см. выше в этой  теме.

16. Аватары. Тут вы можете выставить  ширину и высоту, "вес" картинки пользователя, который они будут загружать с жесткого диска как аватар.
Имейте ввиду,что аватаров на страницу будет много, поэтому большой размер, ширина и высота могут затруднить загрузку форума.

17. Е-мейл. Ваши данные и разрешение на подписку в темах.

18. Регистрация пользователей. Если выбрать НЕТ, пользователей сможет регистрировать только Админ форума, если ДА - они будут делать это сами.

19. Подтверждение на e-mail. Если выбрать НЕТ, пользователь после регистрации сразу входит на форум с указанным им паролем. Если выбрать ДА, будет приходить сгенерированный пароль на e-mail после регистрации.
После входа пользователь может сменить его в своем профиле. Но пароль может идти в течении суток.
И могут возникнуть проблемы с получением пароля на "шаровых" почтовых серверах (не на всех).

20. Анонимные прокси. Если вас терроризирует несознательный спаммер или рекламщик, которого трудно забанить, т.к. он выходит через прокси и легко меняет свой ip-адрес, попробуйте запретить регистрацию с анонимный прокси-серверов, подробнее читайте в этой теме ниже.

21. Правила. Если вы хотите ввести правила на вашем форуме, введите их тут и включите ДА на "показывать правила".

22. Объявление. Между "шапкой" и самим форумом вы можете поставить объявление (не забудьте указать ДА в настройках): написать там текст, поставить календарик и т. п. В тексте объявления допускается использование HTML. Почитайте: Как создать таблицу в объявлении?

23. HTML в форме ответа. Поле для вставки HTML под полем ответа. Оптимально под смайлики, скрипты для работы с текстом. Подробнее о том, что можно там вписать: html-поле под формой ответа.

Пункт: Права

Права в сообщениях:

BBCode Рекомендуется не выключать! Он отвечает за теги, если его отключить, теги перестанут работать. BBCode вы можите отключить нажатием на нет.

Также вы можите отключить возможность вставки изображений. Делается это так: Администрирование >  Права >  Изображения. и нажимаем Нет.

Верхний регистр в сообщении, названии темы. Верхний регистр пример: ЗАЛИП CAPS. Отключается нажатием на нет.

Спросить e-mail у гостя?. Если если включено, то при написании сообщения гость будет должен указать e-mail, если выключено e-mail гость ввести не сможет.

После изменения параметров не забудьте нажать на кнопку "Сохранить".

Права в подписи.
BBCode Рекомендуется не выключать! Он отвечает за теги, если его отключить, теги перестанут работать. BBCode вы можете отключить нажатием на нет.

Так же вы можете отключить возможность вставки изображений в подпись. Делается это так: Администрирование >  Права >  Изображения. и нажимаем Нет.

Верхний регистр в подписе.  Верхний регистр это всё кроме букв. Отключается нажанием на нет.

Подпись можно ограничить длиной и количеством строк

Права модераторов.

Редактирование профиля пользователя, если выключено, то модератор не сможет вносить изменения в профиль пользователя, в том числе не сможет менять статус.

Смена имени пользователя, если включено, то модератор сможет поменять ник любого пользователя, ник администратора, модераторы сменить не могут!

Смена пароля пользователя анологичен предыдущему пункту, только про смену пароля.

Блокировка пользователей, данный пункт даёт возможность блокировать нарушителя. Модератор сможет блокировать если выбрано Да.

Как поставить модератора:

Заходите в профиль пользователя, жмёте Управление,
и выбираете там группу, которую хотите ему присвоить-
сохраняете. Далее выбираете разделы, которые он в дальнейшем
будет модерировать, и жмёте Обновить.

Модерирование форума кратко

Модерирование раздела
Удалить - удалить одну или несколько тем и все сообщения в них без возможности дальнейшего восстановления.

Перенести - перенести одну или несколько тем в другой раздел. Есть возможность оставить ссылки в старом разделе.

Закрыть - запретить оставлять сообщения в одной или нескольких темах всем, кроме администраторов и модераторов раздела.

Открыть - вновь разрешить оставлять сообщения в одной или нескольких темах.
Чтобы моделировать раздел, зайдите в него, и снизу, ниже списка тем, нажмите кнопку "Удалить, Перенести, Открыть или Закрыть темы". После этого проставьте галочки на нужных вам темах и нажмите соответствующую кнопку внизу (Удалить\Перенести\Закрыть\Открыть)

Моделирование темы

Перенести тему - перенести тему в другой раздел. Есть возможность оставить ссылку в старом разделе.

Открыть тему - вновь разрешить оставлять сообщения в теме.

Убрать выделение - пометить тему как обычную. В списке она будет сортироваться как и все обычные темы.

Закрыть тему - запретить оставлять сообщения в теме всем, кроме администраторов и модераторов раздела.

Выделить тему - пометить тему как важную и сделать ее выше всех (кроме других выделенных тем) в разделе.

Удаление сообщений - удалить одно или несколько сообщений в теме.
Перемещение сообщений - переместить одно или несколько сообщений в другую тему.

Перемещение сообщений - первое сообщение в теме переместить нельзя

Объединение сообщений - объединить одно или несколько сообщений в теме (функция иногда глючит!).

Чтобы моделировать тему, зайдите в нее. Если вы хотите использовать Удаление, Перемещение или Объединение сообщений, нажмите соответствующую кнопку, проставьте галочки на нужных сообщениях и нажмите эту кнопку еще раз. Если вы хотите Перенести, Закрыть, Открыть, Выделить или Снять выделение с темы, нажмите соответствующую кнопку. Если нужно, укажите дополнительные данные или подтвердите ваш запрос.

Где находятся HTML-верх  и  HTML-низ ?  Как сменить стиль форума/скин  для всего форума?

Администрирование > Настройки > Основные
HTML-верх  и  HTML-низ  используются для Дизайна или оформления форума, туда же можно вставить код счётчика.

Cменить стиль/скин форума можно так (их очень много на любой вкус):
Администрирование > Настройки >  Основные > Основной стиль